MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Anabaena variabilis ATCC 29413 chromosome

Total Repeats: 127738

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007413	TGCT	2	8	69	76	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_007413	TCT	2	6	81	86	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_007413	AGC	2	6	99	104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_007413	GGT	2	6	108	113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007413	AAT	2	6	233	238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75906226
6	NC_007413	TAA	2	6	246	251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75906226
7	NC_007413	ACT	2	6	299	304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75906226
8	NC_007413	TTACA	2	10	349	358	40 %	40 %	0 %	20 %	75906226
9	NC_007413	TGG	2	6	388	393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75906226
10	NC_007413	GTAT	2	8	481	488	25 %	50 %	25 %	0 %	75906226
11	NC_007413	TAA	2	6	511	516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75906226
12	NC_007413	GA	3	6	562	567	50 %	0 %	50 %	0 %	75906226
13	NC_007413	TGG	2	6	589	594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75906226
14	NC_007413	CTCAT	2	10	612	621	20 %	40 %	0 %	40 %	75906226
15	NC_007413	GCT	2	6	758	763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75906226
16	NC_007413	TGT	2	6	768	773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75906226
17	NC_007413	TAG	2	6	774	779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75906226
18	NC_007413	AAG	2	6	816	821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75906226
19	NC_007413	T	6	6	824	829	0 %	100 %	0 %	0 %	75906226
20	NC_007413	TACAT	2	10	841	850	40 %	40 %	0 %	20 %	75906226
21	NC_007413	AGT	2	6	865	870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75906226
22	NC_007413	CCA	2	6	887	892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	75906226
23	NC_007413	A	6	6	998	1003	100 %	0 %	0 %	0 %	75906226
24	NC_007413	A	6	6	1014	1019	100 %	0 %	0 %	0 %	75906226
25	NC_007413	CTA	2	6	1053	1058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75906226
26	NC_007413	AGC	2	6	1186	1191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75906226
27	NC_007413	CGG	2	6	1268	1273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	75906226
28	NC_007413	GC	3	6	1286	1291	0 %	0 %	50 %	50 %	75906226
29	NC_007413	GAG	2	6	1349	1354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	75906226
30	NC_007413	TGG	2	6	1357	1362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75906226
31	NC_007413	CA	3	6	1370	1375	50 %	0 %	0 %	50 %	75906226
32	NC_007413	TAG	2	6	1410	1415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75906226
33	NC_007413	CAT	2	6	1491	1496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75906226
34	NC_007413	AGAT	2	8	1565	1572	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007413	T	6	6	1606	1611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007413	CGAC	2	8	1988	1995	25 %	0 %	25 %	50 %	75906227
37	NC_007413	ATT	2	6	2140	2145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75906227
38	NC_007413	GA	3	6	2175	2180	50 %	0 %	50 %	0 %	75906227
39	NC_007413	GAT	2	6	2189	2194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75906227
40	NC_007413	TTGA	2	8	2351	2358	25 %	50 %	25 %	0 %	75906227
41	NC_007413	ATT	2	6	2374	2379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75906227
42	NC_007413	CGA	2	6	2392	2397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75906227
43	NC_007413	AGA	2	6	2512	2517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75906227
44	NC_007413	GCC	2	6	2591	2596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	75906227
45	NC_007413	AGAA	2	8	2770	2777	75 %	0 %	25 %	0 %	75906227
46	NC_007413	ATA	2	6	2802	2807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75906227
47	NC_007413	GA	3	6	2881	2886	50 %	0 %	50 %	0 %	75906227
48	NC_007413	GGT	2	6	3032	3037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75906227
49	NC_007413	A	6	6	3357	3362	100 %	0 %	0 %	0 %	75906228
50	NC_007413	AG	3	6	3399	3404	50 %	0 %	50 %	0 %	75906228
51	NC_007413	TGC	2	6	3408	3413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75906228
52	NC_007413	TGA	2	6	3428	3433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75906228
53	NC_007413	GCT	2	6	3490	3495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75906228
54	NC_007413	CTAA	2	8	3535	3542	50 %	25 %	0 %	25 %	75906228
55	NC_007413	GACA	2	8	3549	3556	50 %	0 %	25 %	25 %	75906228
56	NC_007413	CCG	2	6	3568	3573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	75906228
57	NC_007413	CAATAA	2	12	3654	3665	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	75906228
58	NC_007413	AACC	2	8	3721	3728	50 %	0 %	0 %	50 %	75906228
59	NC_007413	CCA	3	9	3776	3784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	75906228
60	NC_007413	AC	3	6	3791	3796	50 %	0 %	0 %	50 %	75906228
61	NC_007413	CCA	2	6	3817	3822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	75906228
62	NC_007413	AT	3	6	3839	3844	50 %	50 %	0 %	0 %	75906228
63	NC_007413	GGT	2	6	3886	3891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75906228
64	NC_007413	ACA	2	6	3952	3957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75906228
65	NC_007413	AAT	2	6	3966	3971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75906228
66	NC_007413	TAC	2	6	3978	3983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75906228
67	NC_007413	CTT	2	6	4028	4033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75906228
68	NC_007413	ATT	2	6	4121	4126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75906229
69	NC_007413	AT	3	6	4203	4208	50 %	50 %	0 %	0 %	75906229
70	NC_007413	CAC	2	6	4224	4229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	75906229
71	NC_007413	TAA	2	6	4260	4265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75906229
72	NC_007413	AC	3	6	4319	4324	50 %	0 %	0 %	50 %	75906229
73	NC_007413	ATA	2	6	4522	4527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75906229
74	NC_007413	TTG	2	6	4530	4535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75906229
75	NC_007413	TAAA	2	8	4585	4592	75 %	25 %	0 %	0 %	75906229
76	NC_007413	ATA	3	9	4621	4629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75906229
77	NC_007413	GAA	2	6	4644	4649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75906229
78	NC_007413	AGT	2	6	4680	4685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75906229
79	NC_007413	AGC	2	6	4767	4772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75906229
80	NC_007413	TGT	2	6	4788	4793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75906229
81	NC_007413	TTGG	2	8	4901	4908	0 %	50 %	50 %	0 %	75906229
82	NC_007413	CTG	2	6	4946	4951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75906229
83	NC_007413	TAG	2	6	5055	5060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75906229
84	NC_007413	GATT	2	8	5063	5070	25 %	50 %	25 %	0 %	75906229
85	NC_007413	A	6	6	5178	5183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007413	AGCC	2	8	5245	5252	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_007413	AAAT	2	8	5285	5292	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007413	TGCA	2	8	5306	5313	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_007413	AG	3	6	5367	5372	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007413	CCG	2	6	5448	5453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	75906230
91	NC_007413	ATA	2	6	5468	5473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75906230
92	NC_007413	CGT	2	6	5492	5497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75906230
93	NC_007413	CTA	2	6	5574	5579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75906230
94	NC_007413	GCT	2	6	5643	5648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75906230
95	NC_007413	AAC	2	6	5704	5709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75906230
96	NC_007413	AGC	2	6	5726	5731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75906230
97	NC_007413	GTC	2	6	5759	5764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75906230
98	NC_007413	GGT	2	6	5770	5775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75906230
99	NC_007413	GAT	2	6	5787	5792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75906230
100	NC_007413	AAT	2	6	5935	5940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75906230
101	NC_007413	TCA	2	6	6069	6074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75906230
102	NC_007413	TAA	2	6	6083	6088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75906230
103	NC_007413	CAG	2	6	6112	6117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75906230
104	NC_007413	TTG	2	6	6160	6165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75906230
105	NC_007413	A	6	6	6184	6189	100 %	0 %	0 %	0 %	75906230
106	NC_007413	GAT	2	6	6190	6195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75906230
107	NC_007413	TTG	2	6	6207	6212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75906230
108	NC_007413	CATA	2	8	6394	6401	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_007413	TTG	2	6	6406	6411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007413	TG	3	6	6498	6503	0 %	50 %	50 %	0 %	75906231
111	NC_007413	AGA	2	6	6555	6560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75906231
112	NC_007413	TTTA	2	8	6578	6585	25 %	75 %	0 %	0 %	75906231
113	NC_007413	CTCA	2	8	6799	6806	25 %	25 %	0 %	50 %	75906231
114	NC_007413	GAA	2	6	6814	6819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75906231
115	NC_007413	GAA	2	6	6832	6837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75906231
116	NC_007413	CGG	2	6	6846	6851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	75906231
117	NC_007413	TAAT	2	8	6909	6916	50 %	50 %	0 %	0 %	75906231
118	NC_007413	GGT	3	9	7040	7048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75906232
119	NC_007413	AGC	2	6	7072	7077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75906232
120	NC_007413	AAG	2	6	7095	7100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75906232
121	NC_007413	ATT	2	6	7184	7189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75906232
122	NC_007413	CAT	2	6	7262	7267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75906232
123	NC_007413	GATA	2	8	7285	7292	50 %	25 %	25 %	0 %	75906232
124	NC_007413	T	6	6	7337	7342	0 %	100 %	0 %	0 %	75906232
125	NC_007413	ATT	2	6	7344	7349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75906232
126	NC_007413	TTC	2	6	7453	7458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_007413	TAC	3	9	7549	7557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_007413	AGAA	2	8	7596	7603	75 %	0 %	25 %	0 %	75906233
129	NC_007413	ATT	2	6	7643	7648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75906233
130	NC_007413	TTG	2	6	7664	7669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75906233
131	NC_007413	CAA	2	6	7690	7695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75906233
132	NC_007413	GGA	2	6	7702	7707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	75906233
133	NC_007413	AGT	2	6	7744	7749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75906233
134	NC_007413	GACA	2	8	7820	7827	50 %	0 %	25 %	25 %	75906233
135	NC_007413	TAA	2	6	7831	7836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75906233
136	NC_007413	TCA	2	6	7837	7842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75906233
137	NC_007413	TCA	2	6	7881	7886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_007413	CAG	2	6	7994	7999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_007413	TTC	2	6	8014	8019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_007413	TAGA	2	8	8023	8030	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007413	T	6	6	8060	8065	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007413	TTC	2	6	8085	8090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_007413	TGA	2	6	8122	8127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007413	CTTA	2	8	8146	8153	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_007413	ATC	2	6	8184	8189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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148	NC_007413	GTA	2	6	8289	8294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75906234
149	NC_007413	CTG	2	6	8390	8395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75906234
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153	NC_007413	TCA	2	6	8701	8706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_007413	ACT	2	6	8708	8713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_007413	ATG	2	6	8766	8771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_007413	TAC	2	6	8934	8939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75906235
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163	NC_007413	AGA	2	6	8999	9004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75906235
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183	NC_007413	AT	3	6	9630	9635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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279	NC_007413	CCG	2	6	15348	15353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	75906242
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390	NC_007413	ATC	2	6	20783	20788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
391	NC_007413	TC	3	6	20838	20843	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
392	NC_007413	GATG	2	8	20846	20853	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
393	NC_007413	CAT	2	6	20864	20869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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398	NC_007413	CGA	2	6	21461	21466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75906248
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